一是申请鉴定主体不同。工伤鉴定申请主体是已被认定为工伤的职工本人、近亲属、雇佣单位均可；而交通事故伤残鉴定申请主体只能是伤者本人。
二是申请鉴定的前提条件不同。工伤鉴定的前提是，工伤申请鉴定主体已经取得了社会保险行政部门出具的职工工伤认定决定书，也即没有工伤认定决定书，工伤鉴定委员会不会受理工伤鉴定申请者的申请；交通事故伤残鉴定的前提是，申请者需提供公安交警部门出具的交通责任事故认定书。
三是申请鉴定的依据、内容和需要提交的材料不同。
工伤鉴定依据的法律、法规是《工伤保险条例》和《职工工伤与职业病致残程度》，鉴定的内容包括：工伤医疗终结期、停工留薪期确认、劳动能力障碍程度、生活自理障碍程度等。申请工伤鉴定时需同时提交的材料有：职工工伤认定决定书、职工工伤医疗的有关资料(包括职工个人情况资料、职工工伤情况资料、医疗机构诊断资料等)；交通事故伤残鉴定依据的法律、法规是《交通事故受伤人员受伤评定》，伤残鉴定的内容包括：伤者精神状态、生理机能、街跑结构的异常及其对生活的影响，交通事故伤残鉴定需提交的材料包括：交通事故认定书、入院记录、出院记录、出院小结、病历本、残疾诊断证明等。
四是申请鉴定的时间不同。工伤鉴定的申请时间是治疗期满(伤者病情相对稳定后)，可以提出申请；交通事故伤残鉴定申请时间是医疗终结后。
法律依据：《工伤保险条例》
第十四条 职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：
（一）在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；
（二）工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；
（三）在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；
（四）患职业病的；
（五）因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；
（六）在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；
（七）法律、行政法规规定应当认定为工伤的其他情形。
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